至元十四年，世祖召见，命侍左右，授后卫经历。十七年，从幸上都

吴元珪，字君璋，广平人，少简重。至元十四年，世祖召见，命侍左右，授后卫经历。十七年，从幸上都，受命取御药于大都万岁山。元珪乘传，未尽一昼夜而至。帝奇其速，擢枢密都事。尝从同知枢密院事俺伯进西蕃铠甲，帝问其制度，元珪应对详明，帝益奇之。枢密院奏京师五卫、行省、万户府设官有差，均俸禄，给医药，设学校，置屯田，多元珪所论建。
大德元年，除吏部尚书。选曹铨注，多私其乡里者，元珪力矫之。累迁工部尚书。河朔连年水旱，五谷不登，元珪言：“盖民力息则生养遂，生养遂则教化行而风俗美。”宰相韪其言，土木之工稍为之息。六年，佥河南行中书省事。初朱清、张瑄以金币赂当道，及败，具籍受赂者姓名，惟元珪一无所污。
武宗即位，由佥枢密院事拜枢密副使。诏议政中书，皆切于世务者。初，诏发军万人屯田称海，海都之乱，被俘者众。至是，颇有来归者饥寒不能存，至鬻子以活。元珪奏其事，诏赐钱赎之。帝在军中，闻元珪名，至是特加平章政事，赐白金二百五十两。
皇庆元年，出拜江浙行省左丞。江淮漕臣言：“江南殷富，盖由多匿腴田，若再行检覆之法，当益田亩累万计。”元珪曰：“江南之平，几四十年，户有定籍，田有定亩，一有动摇，其害不细。”固争月余，不能止，移疾去。复为枢密副使，召见嘉禧殿。帝曰：“卿先朝旧臣，宜在朕左右。”特加荣禄大夫，赐钞五千缗，貂裘二袭。元珪奏曰：“今经理江淮田亩，第以增多为能，有司头会箕敛，俾元元之民困苦日甚，臣恐变生不测，非国之福也。”
英宗即位，元珪与知枢密院事帖木儿不花上言：“诸王近侍不可干军政，管军官吏不可渔取军户，有司赋役当务均一，军官袭职惟传嫡嗣。”帝并嘉纳之。元珪以年老致仕。至治三年卒。